kontsultabg

Sebatkilo-n (Awash, Etiopia) Anopheles eltxoen intsektiziden erresistentziaren genoma osoko populazio-genetika eta monitorizazio molekularra

2012an Djibutin aurkitu zutenetik, Anopheles stephensi eltxo asiarra Afrikako Adarrean zehar hedatu da. Bektore inbaditzaile honek kontinentean zehar hedatzen jarraitzen du, eta mehatxu larria da malariaren kontrolerako programentzat. Bektoreen kontrol metodoek, besteak beste, intsektizidekin tratatutako ohe-sareek eta barruko ihinztadura erresistenteek, malariaren zama nabarmen murriztu dute. Hala ere, intsektizidekiko erresistenteak diren eltxoen prebalentzia gero eta handiagoak, Anopheles stephensi populazioak barne, malaria ezabatzeko ahaleginak oztopatzen ari da. Populazioen egitura, populazioen arteko gene-fluxua eta intsektiziden erresistentzia-mutazioen banaketa ulertzea ezinbestekoa da malariaren kontrolerako estrategia eraginkorrak gidatzeko.
An. stephensi HOA-n nola finkatu zen hobeto ulertzea ezinbestekoa da eremu berrietara hedatzeko aukera aurreikusteko. Populazioen genetika asko erabili da bektore espezieak aztertzeko, populazio egitura, etengabeko hautespena eta geneen fluxua ezagutzeko18,19. An. stephensirentzat, populazio egitura eta genomaren egitura aztertzeak bere inbasio bidea eta agertu zenetik gertatu den edozein eboluzio egokitzaile argitzen lagun dezake. Geneen fluxuaz gain, hautespena bereziki garrantzitsua da, intsektiziden erresistentziarekin lotutako aleloak identifikatu eta alelo horiek populazioan nola hedatzen diren argitu baitezake20.
Orain arte, Anopheles stephensi espezie inbaditzailearen intsektiziden erresistentzia markatzaileen eta populazio genetikaren probak hautagai gene gutxi batzuetara mugatu dira. Espeziearen agerpena Afrikan ez da guztiz ulertzen, baina hipotesi bat da gizakiek edo abereek sartu zutela. Beste teoria batzuek haizearen bidezko distantzia luzeko migrazioa barne hartzen dute. Ikerketa honetan erabilitako Etiopiako isolatuak Awash Sebat Kilon bildu ziren, Addis Abebatik 200 km ekialdera eta Addis Abebatik Djibutirako garraio korridore nagusian kokatutako herri batean. Awash Sebat Kilo malariaren transmisio handiko eremua da eta Anopheles stephensi populazio handia du, intsektizidekiko erresistentea dela jakinarazi denez, Anopheles stephensi-ren populazio genetika aztertzeko gune garrantzitsua bihurtuz8.
Intsektiziden aurkako erresistentzia mutazioa kdr L1014F maiztasun baxuan detektatu zen Etiopiako populazioan eta ez zen detektatu Indiako laginetan. Kdr mutazio honek piretroideen eta DDTaren aurkako erresistentzia ematen du eta lehenago detektatu zen 2016an Indian eta 2018an Afganistanen bildutako An. stephensi populazioetan.31,32 Bi hirietan piretroideen aurkako erresistentzia zabaldua dagoela frogatu arren, kdr L1014F mutazioa ez zen detektatu hemen aztertutako Mangalore eta Bangalore populazioetan. SNP hau zuten eta heterozigotoak ziren Etiopiako isolatuen proportzio txikiak iradokitzen du mutazioa duela gutxi sortu zela populazio honetan. Hori Awash-en egindako aurreko ikerketa batek berresten du, non ez zen kdr mutazioaren ebidentziarik aurkitu hemen aztertutakoen aurreko urtean bildutako laginetan.18 Aurretik, kdr L1014F mutazio hau maiztasun baxuan identifikatu genuen eskualde/urte bereko lagin multzo batean, anplikoi detekzio bidezko ikuspegi bat erabiliz.28 Laginketa guneetan erresistentzia fenotipikoa dagoela kontuan hartuta, erresistentzia markatzaile honen alelo maiztasun baxuak iradokitzen du helburu gunearen aldaketaz besteko mekanismoak direla behatutako fenotipo honen erantzule.
Ikerketa honen muga bat intsektiziden erantzunari buruzko datu fenotipoen falta da. Genoma osoaren sekuentziazioa (WGS) edo anplikoi-sekuentziazio zuzendua suszeptibilitate-bioanalisiekin konbinatzen dituzten ikerketa gehiago behar dira mutazio hauek intsektiziden erantzunean duten eragina ikertzeko. Erresistentziarekin lotuta egon daitezkeen SNP missense berri hauek errendimendu handiko analisi molekularretarako bideratu beharko lirateke, jarraipena laguntzeko eta erresistentzia-fenotipoekin lotutako mekanismo potentzialak ulertzeko eta balioztatzeko lan funtzionala errazteko.
Laburbilduz, ikerketa honek Anopheles eltxoen populazioen genetika sakonago ulertzen laguntzen du kontinenteetan zehar. Genoma osoaren sekuentziazioaren (WGS) analisia eskualde geografiko desberdinetako lagin-kohorte handiagoetan aplikatzea funtsezkoa izango da geneen fluxua ulertzeko eta intsektiziden erresistentziaren markatzaileak identifikatzeko. Ezagutza honek osasun publikoko agintariei aukera informatuak egiteko aukera emango die bektoreen zaintzan eta intsektiziden erabileran.
Datu-multzo honetan kopia-zenbakiaren aldakuntza detektatzeko bi ikuspegi erabili genituen. Lehenik, genoman identifikatutako CYP gene-multzoetan oinarritutako estaldura-oinarritutako ikuspegi bat erabili genuen (S5 taula osagarria). Laginaren estaldura bilketa-kokapenen batez bestekoa kalkulatu zen eta lau taldetan banatu zen: Etiopia, Indiako zelaiak, Indiako koloniak eta Pakistango koloniak. Talde bakoitzerako estaldura kernel leuntzea erabiliz normalizatu zen eta, ondoren, talde horren genomaren estaldura-sakonera medianaren arabera irudikatu zen.


Argitaratze data: 2025eko ekainaren 23a